45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2504 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  59.72 
 
 		 216 aa  244  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  54.3 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  52.25 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  49.31 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.31 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.54 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  49.77 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  52.59 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  53.67 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  49.3 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  47.89 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.3 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.54 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.3 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.3 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  52.16 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  50.43 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  50.43 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  50.43 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  50 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  50.86 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  50.43 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  50.43 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  50.21 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  45.5 
 
 		 192 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  46.77 
 
 		 197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  39.9 
 
 		 173 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  41.58 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  41.58 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  40.37 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  40 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  37.44 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  40.31 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  40.31 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  40.31 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  40.31 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  39.79 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  38.07 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  37.77 
 
 		 155 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  38.3 
 
 		 155 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  62.32 
 
 		 91 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  29.14 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>