45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4483 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  98.59 
 
 
213 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  96.71 
 
 
213 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  96.71 
 
 
213 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  96.71 
 
 
213 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  95.31 
 
 
213 aa  417  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  96.24 
 
 
213 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  96.24 
 
 
213 aa  418  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  94.37 
 
 
213 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  93.43 
 
 
213 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  77.78 
 
 
216 aa  341  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  51.13 
 
 
219 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  49.31 
 
 
216 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  48.42 
 
 
217 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  48.03 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  48.03 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  47.6 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  50.7 
 
 
216 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  47.6 
 
 
230 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  47.6 
 
 
230 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  47.6 
 
 
230 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  47.6 
 
 
230 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  47.6 
 
 
230 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  46.96 
 
 
231 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  46.29 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  44.76 
 
 
216 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  40.61 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  39.25 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  40 
 
 
168 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  40 
 
 
168 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  40 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  40.54 
 
 
168 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  40 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  40 
 
 
168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  40 
 
 
168 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  37.11 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  37.84 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  36.13 
 
 
155 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  37.63 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  35.27 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  35.64 
 
 
155 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  56.94 
 
 
91 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  32.18 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>