45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3116 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  100 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  78.7 
 
 
213 aa  343  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  77.78 
 
 
218 aa  341  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  78.24 
 
 
213 aa  340  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  78.24 
 
 
213 aa  340  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  78.24 
 
 
213 aa  340  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  78.24 
 
 
213 aa  340  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  78.24 
 
 
213 aa  340  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  75.93 
 
 
213 aa  333  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  75.46 
 
 
213 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  76.39 
 
 
213 aa  332  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  49.77 
 
 
216 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  47.79 
 
 
219 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  45.91 
 
 
217 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  50 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  46.96 
 
 
230 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  46.96 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  46.98 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  46.98 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  46.98 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  46.98 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  46.98 
 
 
230 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  46.96 
 
 
230 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  46.12 
 
 
231 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  46.96 
 
 
230 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  44.29 
 
 
216 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  40.86 
 
 
192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  42.13 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  39.69 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  36.5 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  40.54 
 
 
168 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  40.54 
 
 
168 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  40.54 
 
 
168 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  40.54 
 
 
168 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  49.65 
 
 
168 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  50.35 
 
 
168 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  49.32 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  49.32 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  40 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  48.23 
 
 
168 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  38.3 
 
 
155 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  39.46 
 
 
155 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  34.67 
 
 
211 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  62.32 
 
 
91 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  34.55 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>