46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_C0050 on replicon NC_011655
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  77.92 
 
 
155 aa  240  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  62.03 
 
 
168 aa  197  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  61.39 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  61.39 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  60.76 
 
 
168 aa  193  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  60.76 
 
 
168 aa  193  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  60.76 
 
 
168 aa  193  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  60.76 
 
 
168 aa  193  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  60.13 
 
 
168 aa  191  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  60 
 
 
168 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  58.86 
 
 
168 aa  187  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  57.69 
 
 
173 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  84.88 
 
 
91 aa  154  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  40.57 
 
 
192 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  42.29 
 
 
197 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.7 
 
 
213 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  36.13 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  37.3 
 
 
213 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  37.84 
 
 
213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  37.77 
 
 
216 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  35.64 
 
 
213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  37.3 
 
 
213 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  37.3 
 
 
213 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  37.3 
 
 
213 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  37.3 
 
 
213 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.17 
 
 
213 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  38.3 
 
 
216 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  32.98 
 
 
217 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  36.56 
 
 
216 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  33.01 
 
 
231 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  35.57 
 
 
219 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  35.57 
 
 
216 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  33.66 
 
 
230 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  32.2 
 
 
230 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  32.2 
 
 
230 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  32.2 
 
 
230 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  32.2 
 
 
230 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  32.2 
 
 
230 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  32.2 
 
 
230 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  35.15 
 
 
179 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  33.17 
 
 
230 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  32.2 
 
 
230 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2846  transcription factor, RsfA family  75 
 
 
64 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  32.39 
 
 
211 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  33.33 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>