45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3906 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  82.33 
 
 
230 aa  356  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  81.9 
 
 
230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  82.4 
 
 
231 aa  354  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  82.61 
 
 
230 aa  353  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  83.04 
 
 
230 aa  353  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  83.04 
 
 
230 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  83.04 
 
 
230 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  81.47 
 
 
230 aa  352  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  83.04 
 
 
230 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  83.04 
 
 
230 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  63.35 
 
 
219 aa  266  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  62.5 
 
 
217 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  53.67 
 
 
216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  50 
 
 
216 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  50.23 
 
 
213 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  50.7 
 
 
218 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  50.7 
 
 
213 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.54 
 
 
213 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.54 
 
 
213 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.54 
 
 
213 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  49.54 
 
 
213 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.3 
 
 
213 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  49.77 
 
 
213 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  49.3 
 
 
213 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  44.24 
 
 
216 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  41.59 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  41.58 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  39.79 
 
 
173 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  37.44 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  37.44 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  37.17 
 
 
168 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  38.1 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  37.44 
 
 
168 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  37.44 
 
 
168 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  37.44 
 
 
168 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  37.44 
 
 
168 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  34.06 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  37.5 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  37.91 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  36.97 
 
 
168 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  37.17 
 
 
155 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  52.33 
 
 
91 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  32.11 
 
 
155 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  30.54 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>