46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5677 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  100 
 
 
155 aa  317  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  77.92 
 
 
155 aa  240  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  57.42 
 
 
168 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  57.42 
 
 
168 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  57.42 
 
 
168 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  56.77 
 
 
168 aa  183  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  56.77 
 
 
168 aa  183  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  56.77 
 
 
168 aa  183  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  56.77 
 
 
168 aa  183  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  56.96 
 
 
168 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  54.19 
 
 
173 aa  180  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  55.48 
 
 
168 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  54.84 
 
 
168 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  80.23 
 
 
91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  41.24 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  40.7 
 
 
197 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  39.46 
 
 
216 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  34.9 
 
 
219 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  38.3 
 
 
216 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  37.1 
 
 
216 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  34.03 
 
 
217 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.22 
 
 
213 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  36.22 
 
 
213 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.22 
 
 
213 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.22 
 
 
213 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  36.22 
 
 
213 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.22 
 
 
213 aa  104  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.22 
 
 
213 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  35.64 
 
 
218 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  36.22 
 
 
213 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  36.36 
 
 
179 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  35.68 
 
 
213 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  33.82 
 
 
230 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  47.06 
 
 
231 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  34.15 
 
 
230 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  51.85 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  51.85 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  32.11 
 
 
216 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  32.84 
 
 
230 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  32.84 
 
 
230 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  32.84 
 
 
230 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  32.84 
 
 
230 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  50.62 
 
 
230 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  35.03 
 
 
211 aa  90.5  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2846  transcription factor, RsfA family  70.49 
 
 
64 aa  87  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084628 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  33.33 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>