46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3968 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  98.21 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  98.21 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  98.21 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  98.21 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  97.62 
 
 		 168 aa  333  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  94.64 
 
 		 168 aa  325  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  94.64 
 
 		 168 aa  324  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  94.05 
 
 		 168 aa  322  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  76.3 
 
 		 173 aa  258  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  61.39 
 
 		 155 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  57.42 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  48 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  48.47 
 
 		 197 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  40 
 
 		 218 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.54 
 
 		 213 aa  120  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  40.54 
 
 		 213 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  69.74 
 
 		 91 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  40 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.54 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.54 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.54 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  40.54 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  39.46 
 
 		 213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.54 
 
 		 213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  40 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  49.32 
 
 		 216 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  35.38 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  37.78 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  36.02 
 
 		 216 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  36.73 
 
 		 231 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  37.33 
 
 		 230 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  35.98 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  36.44 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  34.67 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  40.6 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  34.67 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  34.67 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  34.67 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  34.67 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  68.57 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  49.07 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  29.94 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2846  transcription factor, RsfA family  54.1 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>