45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1880 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1880  transcription factor, RsfA family  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1008  transcription factor, RsfA family  66.33 
 
 		 197 aa  221  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3773  DNA-binding protein  48 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000247041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2572  transcription factor RsfA  48.86 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000145414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3664  hypothetical protein  48 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.52725e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4061  DNA-binding protein  48 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000119169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3681  hypothetical protein  48 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3968  DNA-binding protein, putative  48 
 
 		 168 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3975  putative DNA-binding protein  48 
 
 		 168 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000323881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3937  putative DNA-binding protein  48 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1218  putative DNA-binding protein  46.2 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2504  transcription factor, RsfA family  45.5 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000439495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4023  putative DNA-binding protein  46.29 
 
 		 168 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3749  transcription factor RsfA  46.86 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000182972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1264  transcription factor, RsfA family  45.03 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5677  transcription factor RsfA  41.24 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  decreased coverage  0.000514818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3116  transcription factor RsfA  40.86 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0050  transcription factor, RsfA family  40.57 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.323151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0716  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  41.21 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000935709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3470  transcription factor, RsfA family  38.95 
 
 		 217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0947  transcription factor, RsfA family  40.4 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4247  transcription factor RsfA  41.76 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00445226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3362  transcription factor, RsfA family  38.22 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0415143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4533  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.11 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000084092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4483  prespore-specific transcriptional regulator rsfA, putative  39.25 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4143  prespore-specific transcriptional regulator  40.11 
 
 		 213 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000057077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4132  prespore-specific transcriptional regulator  40.11 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4520  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.66 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4629  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.11 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4480  putative prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.11 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4688500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4295  prespore-specific transcriptional regulator rsfA  40.11 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00106678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3906  transcription factor RsfA  41.05 
 
 		 216 aa  121  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5178  transcription factor RsfA  38.92 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0431  transcription factor, RsfA family  38.42 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5563  hypothetical protein  39.6 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5514  hypothetical protein  39.6 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5082  prespore specific transcriptional activator  38.12 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5508  hypothetical protein  37.13 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5443  hypothetical protein  37.62 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2845  transcription factor, RsfA family  62.96 
 
 		 91 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000090541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5477  hypothetical protein  37.14 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5235  hypothetical protein  37.14 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5065  prespore specific transcriptional activator rsfA  37.14 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5633  hypothetical protein  37.14 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0217  transcription factor, RsfA family  32.38 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>