172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2155 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  100 
 
 
557 aa  1100    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  96.41 
 
 
557 aa  988    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  55.38 
 
 
561 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  50.64 
 
 
543 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  48.18 
 
 
543 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  36.23 
 
 
562 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.27 
 
 
541 aa  297  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.62 
 
 
556 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.04 
 
 
541 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  31.65 
 
 
557 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.68 
 
 
541 aa  290  6e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.86 
 
 
541 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.2 
 
 
536 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.91 
 
 
548 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  29.98 
 
 
537 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  30.16 
 
 
537 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.63 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30 
 
 
554 aa  259  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.03 
 
 
574 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.6 
 
 
566 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.9 
 
 
643 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.65 
 
 
539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.88 
 
 
567 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.41 
 
 
556 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  31.77 
 
 
559 aa  228  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.37 
 
 
559 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.23 
 
 
556 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.85 
 
 
563 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.8 
 
 
586 aa  226  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.89 
 
 
538 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.73 
 
 
584 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.79 
 
 
555 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.79 
 
 
555 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.66 
 
 
590 aa  220  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1780  Na+/Pi-cotransporter  32.1 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.19 
 
 
549 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.62 
 
 
535 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  29.51 
 
 
549 aa  212  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.54 
 
 
636 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  27.02 
 
 
551 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  27.02 
 
 
551 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  27.02 
 
 
544 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  27.21 
 
 
551 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  26.84 
 
 
551 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  26.65 
 
 
551 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  26.84 
 
 
551 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.99 
 
 
551 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  31.32 
 
 
586 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.7 
 
 
564 aa  203  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  26.24 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  26.29 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.95 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.99 
 
 
565 aa  197  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.29 
 
 
551 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  33.33 
 
 
555 aa  193  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.09 
 
 
558 aa  183  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.39 
 
 
564 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.32 
 
 
570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  28.62 
 
 
563 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  28.78 
 
 
565 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  33.92 
 
 
600 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  28.07 
 
 
563 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  28.65 
 
 
558 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.37 
 
 
318 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  28.22 
 
 
592 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.92 
 
 
562 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.42 
 
 
565 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  28.77 
 
 
566 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  27.87 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.26 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.96 
 
 
549 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.87 
 
 
553 aa  144  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  28.09 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.15 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  26.39 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.34 
 
 
552 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  25.14 
 
 
561 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  25.86 
 
 
582 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.5 
 
 
576 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 
554 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  26 
 
 
558 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.36 
 
 
556 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  25.29 
 
 
557 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.36 
 
 
556 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  25.32 
 
 
560 aa  137  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.72 
 
 
559 aa  134  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  25.45 
 
 
558 aa  134  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  25.98 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  25.09 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.33 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.39 
 
 
546 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  25.53 
 
 
550 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.66 
 
 
548 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  31.94 
 
 
289 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.42 
 
 
556 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  28.13 
 
 
578 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  26.21 
 
 
552 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.72 
 
 
304 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.13 
 
 
552 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>