190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1777 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  100 
 
 
600 aa  1191    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.5 
 
 
636 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  35.78 
 
 
586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.42 
 
 
643 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  36.95 
 
 
535 aa  268  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.79 
 
 
564 aa  266  8e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.52 
 
 
548 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  33.06 
 
 
557 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  31.99 
 
 
537 aa  256  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  32.48 
 
 
537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.58 
 
 
554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.93 
 
 
536 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.5 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.6 
 
 
549 aa  253  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.86 
 
 
541 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.86 
 
 
541 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.32 
 
 
541 aa  251  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.4 
 
 
587 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.32 
 
 
566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.23 
 
 
538 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  37.74 
 
 
566 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.61 
 
 
567 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  38.38 
 
 
559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.94 
 
 
576 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  31.77 
 
 
551 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  32.51 
 
 
544 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  31.9 
 
 
551 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  34.13 
 
 
555 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  31.9 
 
 
551 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  31.9 
 
 
551 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.11 
 
 
584 aa  224  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  31.72 
 
 
551 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  31.55 
 
 
551 aa  223  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  31.17 
 
 
551 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.13 
 
 
551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  30.65 
 
 
551 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.38 
 
 
555 aa  220  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.38 
 
 
555 aa  220  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.38 
 
 
556 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.47 
 
 
558 aa  219  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  31.54 
 
 
562 aa  217  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.75 
 
 
556 aa  216  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.98 
 
 
590 aa  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.4 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.81 
 
 
574 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.24 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.5 
 
 
564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.48 
 
 
539 aa  212  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.77 
 
 
559 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.79 
 
 
586 aa  210  7e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.44 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.89 
 
 
565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  32.78 
 
 
549 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  28.14 
 
 
561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  33.24 
 
 
592 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  34.64 
 
 
559 aa  178  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  29.12 
 
 
554 aa  176  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.69 
 
 
562 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.5 
 
 
535 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.95 
 
 
570 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  27.7 
 
 
563 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.02 
 
 
310 aa  165  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  25.22 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1019  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.51 
 
 
311 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.08 
 
 
318 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  35.79 
 
 
557 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.56 
 
 
565 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.44 
 
 
556 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  27.22 
 
 
565 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  32.69 
 
 
308 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.35 
 
 
304 aa  157  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  32.09 
 
 
578 aa  156  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  24.2 
 
 
558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  24.08 
 
 
557 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.64 
 
 
601 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.42 
 
 
311 aa  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.37 
 
 
553 aa  151  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  25.28 
 
 
561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  33.71 
 
 
557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.88 
 
 
576 aa  147  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0549  Na/Pi-cotransporter, putative  27.39 
 
 
589 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  36.54 
 
 
289 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  24.64 
 
 
548 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.9 
 
 
577 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.96 
 
 
556 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.66 
 
 
556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1943  Na+/Pi-cotransporter  27.54 
 
 
584 aa  140  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0628  Na/Pi-cotransporter, putative  26.97 
 
 
550 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  23.38 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.25 
 
 
570 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.17 
 
 
549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.11 
 
 
552 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  22.99 
 
 
548 aa  136  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  24.96 
 
 
556 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  23.58 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2701  Na+/Pi-cotransporter  29.05 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.71 
 
 
552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.47 
 
 
552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.04 
 
 
552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1695  Na+/Picotransporter  29.36 
 
 
571 aa  130  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.483825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>