171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2073 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  100 
 
 
563 aa  1120    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  74.77 
 
 
565 aa  800    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  49.26 
 
 
565 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  49.17 
 
 
553 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  46.52 
 
 
561 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.61 
 
 
601 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  43.3 
 
 
563 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.56 
 
 
562 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  43.31 
 
 
577 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.96 
 
 
576 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.16 
 
 
552 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.45 
 
 
556 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.45 
 
 
556 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  42.96 
 
 
582 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  44.96 
 
 
548 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  43.28 
 
 
558 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  42.42 
 
 
582 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  43.82 
 
 
553 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  44.33 
 
 
578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  43.02 
 
 
559 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  42.94 
 
 
562 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  41.34 
 
 
549 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  43.73 
 
 
565 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  40.07 
 
 
552 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.7 
 
 
552 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.89 
 
 
552 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  42.99 
 
 
561 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.51 
 
 
552 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  42.53 
 
 
548 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  40 
 
 
552 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  39.71 
 
 
550 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  41.7 
 
 
553 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.38 
 
 
548 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  39.67 
 
 
550 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  41.12 
 
 
546 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.93 
 
 
548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.77 
 
 
548 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.93 
 
 
543 aa  354  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.89 
 
 
548 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  40.78 
 
 
543 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  40.78 
 
 
543 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  40.78 
 
 
543 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  40.78 
 
 
543 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  40.78 
 
 
543 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  40.11 
 
 
543 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  40.11 
 
 
543 aa  350  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.82 
 
 
570 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  40.11 
 
 
543 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.5 
 
 
548 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  35.96 
 
 
558 aa  337  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  36.51 
 
 
560 aa  336  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  35.6 
 
 
558 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  42.72 
 
 
561 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  39.03 
 
 
568 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  42.94 
 
 
555 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  35.24 
 
 
556 aa  321  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  42.25 
 
 
555 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  42.08 
 
 
561 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  42.13 
 
 
564 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  34.75 
 
 
557 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.63 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.22 
 
 
548 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.98 
 
 
547 aa  303  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.24 
 
 
567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  32.25 
 
 
562 aa  270  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.72 
 
 
542 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.88 
 
 
566 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  32.65 
 
 
548 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.6 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.46 
 
 
556 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  31.2 
 
 
535 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.91 
 
 
558 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  26.78 
 
 
537 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  26.68 
 
 
537 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.78 
 
 
643 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.76 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.13 
 
 
565 aa  196  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.59 
 
 
536 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.94 
 
 
636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.16 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.72 
 
 
539 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  27.35 
 
 
559 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.89 
 
 
541 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.11 
 
 
541 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  24.41 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  24.41 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.45 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.41 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  24.41 
 
 
551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  24.23 
 
 
551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  24.59 
 
 
551 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  24.41 
 
 
544 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.07 
 
 
541 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.21 
 
 
554 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>