176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1406 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  69.41 
 
 
548 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.39 
 
 
547 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  70.46 
 
 
548 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  100 
 
 
548 aa  1080    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  59.85 
 
 
542 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  40.59 
 
 
563 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  46.97 
 
 
561 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  47.34 
 
 
561 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  47.05 
 
 
564 aa  359  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  39.38 
 
 
563 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.15 
 
 
576 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.95 
 
 
552 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.74 
 
 
556 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.55 
 
 
556 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  37.23 
 
 
558 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  37.23 
 
 
558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  38.75 
 
 
558 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  38.56 
 
 
565 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.57 
 
 
549 aa  336  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  36.14 
 
 
560 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.72 
 
 
577 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.55 
 
 
565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  36.35 
 
 
557 aa  327  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.32 
 
 
562 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  37.64 
 
 
582 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  37.59 
 
 
582 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.95 
 
 
559 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.65 
 
 
553 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  38.32 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  38.32 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  38.32 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  38.32 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  38.32 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  38.42 
 
 
565 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  34.95 
 
 
556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  37.18 
 
 
561 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.01 
 
 
543 aa  313  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.4 
 
 
548 aa  313  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.21 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.06 
 
 
601 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.69 
 
 
561 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.09 
 
 
552 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.96 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  37.36 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.73 
 
 
552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.36 
 
 
552 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.41 
 
 
553 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  37.15 
 
 
553 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.36 
 
 
552 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.04 
 
 
570 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  36.07 
 
 
543 aa  299  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.89 
 
 
548 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  35.89 
 
 
543 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  35.89 
 
 
543 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.89 
 
 
543 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  35.89 
 
 
543 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  35.89 
 
 
543 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  35.89 
 
 
543 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.89 
 
 
543 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  35.82 
 
 
543 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  35.14 
 
 
552 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  37.29 
 
 
548 aa  289  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.85 
 
 
562 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.3 
 
 
546 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  34.01 
 
 
550 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  34.57 
 
 
550 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  33.33 
 
 
548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  34.23 
 
 
578 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  30 
 
 
562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.63 
 
 
566 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.52 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.01 
 
 
558 aa  238  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  33.76 
 
 
568 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.51 
 
 
567 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.99 
 
 
556 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  25.14 
 
 
537 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  37.7 
 
 
555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  25.09 
 
 
537 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.7 
 
 
535 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  36.56 
 
 
555 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.05 
 
 
536 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.44 
 
 
565 aa  192  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.01 
 
 
643 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.68 
 
 
548 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.51 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.63 
 
 
538 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.35 
 
 
576 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  26.21 
 
 
559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.27 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  24.68 
 
 
551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  24.68 
 
 
551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  24.54 
 
 
551 aa  174  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  25.05 
 
 
551 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.75 
 
 
554 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  24.72 
 
 
551 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  24.86 
 
 
544 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  24.35 
 
 
551 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.3 
 
 
551 aa  170  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  23.79 
 
 
551 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.48 
 
 
564 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>