190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1000 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  100 
 
 		 559 aa  1125    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  58.98 
 
 		 564 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  56.29 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  56.47 
 
 		 566 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.39 
 
 		 643 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.15 
 
 		 536 aa  289  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.86 
 
 		 636 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.77 
 
 		 566 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.7 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  32.19 
 
 		 535 aa  273  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.19 
 
 		 541 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  33.27 
 
 		 562 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  34.66 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  31.21 
 
 		 537 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.73 
 
 		 541 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.96 
 
 		 541 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.2 
 
 		 548 aa  266  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.98 
 
 		 576 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  30.6 
 
 		 537 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.78 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  30.49 
 
 		 551 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.36 
 
 		 551 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.44 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  29.95 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  32.39 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  29.95 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  29.95 
 
 		 551 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  29.95 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  29.78 
 
 		 551 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  29.95 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  29.76 
 
 		 544 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  29.76 
 
 		 551 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.7 
 
 		 563 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.89 
 
 		 558 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.9 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.76 
 
 		 551 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.05 
 
 		 556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.07 
 
 		 554 aa  233  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.08 
 
 		 556 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.49 
 
 		 538 aa  226  8e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.72 
 
 		 539 aa  224  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  38.38 
 
 		 600 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.74 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.8 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  31.29 
 
 		 561 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.79 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.24 
 
 		 574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.11 
 
 		 555 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.11 
 
 		 555 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.24 
 
 		 556 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.67 
 
 		 584 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.53 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  34.01 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  31.36 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  30.26 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.89 
 
 		 318 aa  193  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  31 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.84 
 
 		 564 aa  187  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.77 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  31.22 
 
 		 549 aa  183  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  27.16 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.21 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  27.35 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.97 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.97 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  24.3 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.75 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.57 
 
 		 601 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  32.87 
 
 		 554 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.93 
 
 		 576 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.39 
 
 		 547 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.7 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  30.92 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  35.84 
 
 		 289 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.15 
 
 		 562 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.37 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.43 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  26.62 
 
 		 548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  26.5 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.28 
 
 		 549 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  25.76 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.59 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.98 
 
 		 304 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  27.42 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.29 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  26.41 
 
 		 552 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  26.35 
 
 		 548 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.54 
 
 		 561 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  25.92 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  25.62 
 
 		 582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.14 
 
 		 310 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.53 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1019  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.81 
 
 		 311 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  25.53 
 
 		 582 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.96 
 
 		 552 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.78 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.59 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  27.25 
 
 		 559 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.81 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  24.87 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>