More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2362 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  95.72 
 
 
537 aa  1044    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  100 
 
 
537 aa  1084    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.83 
 
 
541 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.85 
 
 
541 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.83 
 
 
541 aa  488  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  48.66 
 
 
541 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.99 
 
 
576 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.29 
 
 
554 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  42.75 
 
 
544 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  42.02 
 
 
551 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  42.39 
 
 
551 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  42.75 
 
 
551 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  42.2 
 
 
551 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  42.2 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.36 
 
 
538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  42.2 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.67 
 
 
536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  42.57 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  42.2 
 
 
551 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.68 
 
 
551 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.81 
 
 
548 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.8 
 
 
590 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.2 
 
 
551 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.55 
 
 
539 aa  379  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.73 
 
 
549 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  38.69 
 
 
562 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.21 
 
 
559 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.32 
 
 
584 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.94 
 
 
570 aa  329  8e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.36 
 
 
556 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.33 
 
 
564 aa  322  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  34.37 
 
 
557 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.27 
 
 
567 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.64 
 
 
587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.77 
 
 
555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.77 
 
 
555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.43 
 
 
566 aa  309  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.46 
 
 
563 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.33 
 
 
643 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.99 
 
 
636 aa  307  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  31.82 
 
 
535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.26 
 
 
574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.03 
 
 
564 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.53 
 
 
556 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.36 
 
 
558 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.56 
 
 
565 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  33.09 
 
 
549 aa  262  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  29.94 
 
 
561 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  30.6 
 
 
559 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  34.4 
 
 
586 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.45 
 
 
556 aa  256  9e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  34.5 
 
 
555 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.92 
 
 
586 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  30.16 
 
 
557 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  29.28 
 
 
557 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  27.53 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  32.48 
 
 
600 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  26.78 
 
 
563 aa  226  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.14 
 
 
548 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.62 
 
 
547 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.97 
 
 
304 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  29.68 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.43 
 
 
556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.43 
 
 
556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.32 
 
 
549 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  28.88 
 
 
566 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  24.91 
 
 
563 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.21 
 
 
318 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  29.1 
 
 
592 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  38.24 
 
 
308 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  25.65 
 
 
543 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  25.65 
 
 
543 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  25.65 
 
 
543 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  25.65 
 
 
543 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  25.65 
 
 
543 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.85 
 
 
565 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.32 
 
 
576 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.91 
 
 
577 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  30.3 
 
 
543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  25.37 
 
 
582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  25.46 
 
 
582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  26.49 
 
 
561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.86 
 
 
543 aa  198  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.38 
 
 
552 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  25.65 
 
 
543 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.65 
 
 
543 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.65 
 
 
543 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  24.49 
 
 
548 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  25.65 
 
 
543 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  25.65 
 
 
543 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  25.65 
 
 
543 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  23.93 
 
 
548 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  25.46 
 
 
543 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24 
 
 
552 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  25.65 
 
 
543 aa  194  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.19 
 
 
552 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.1 
 
 
552 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  25.84 
 
 
543 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.05 
 
 
562 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>