172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0161 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  63.62 
 
 		 543 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.62 
 
 		 543 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  98.19 
 
 		 552 aa  1073    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  80.87 
 
 		 550 aa  849    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  81.11 
 
 		 550 aa  861    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  82.07 
 
 		 552 aa  875    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.35 
 
 		 548 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.62 
 
 		 543 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  69.03 
 
 		 582 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  63.62 
 
 		 543 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  94.2 
 
 		 552 aa  1036    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.5 
 
 		 543 aa  641    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  72.93 
 
 		 546 aa  748    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  98.55 
 
 		 552 aa  1078    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.43 
 
 		 543 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.78 
 
 		 548 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  69.03 
 
 		 582 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.62 
 
 		 543 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.62 
 
 		 543 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.62 
 
 		 543 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  64.85 
 
 		 549 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.81 
 
 		 543 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  100 
 
 		 552 aa  1095    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  60.07 
 
 		 548 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  60.26 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  61.59 
 
 		 568 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  61.09 
 
 		 570 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.8 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  56.62 
 
 		 565 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  52.63 
 
 		 563 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.53 
 
 		 561 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  53.95 
 
 		 558 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.84 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.72 
 
 		 576 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.86 
 
 		 577 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.4 
 
 		 559 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.37 
 
 		 556 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.37 
 
 		 556 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.03 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  47.15 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  44.8 
 
 		 548 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  40.07 
 
 		 563 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  38.22 
 
 		 565 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.76 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.26 
 
 		 562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.73 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.21 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  35.57 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  32.46 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.33 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  32.53 
 
 		 548 aa  287  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  32.85 
 
 		 556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  32.19 
 
 		 558 aa  282  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  32.01 
 
 		 558 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.74 
 
 		 547 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  32.25 
 
 		 560 aa  276  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  32.14 
 
 		 548 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.01 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  38.42 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  38.68 
 
 		 561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  33.7 
 
 		 548 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  32.79 
 
 		 578 aa  250  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  38.68 
 
 		 564 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  29.94 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  30.3 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  34.12 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  35.16 
 
 		 555 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  32.41 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.86 
 
 		 567 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.4 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  24 
 
 		 537 aa  194  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.15 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.31 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.53 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  23.62 
 
 		 537 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.02 
 
 		 549 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.91 
 
 		 551 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.29 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.29 
 
 		 541 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  25.09 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  24.91 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.61 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  24.73 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.89 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  24.91 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  24.91 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  24.91 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  24.91 
 
 		 551 aa  163  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  24.91 
 
 		 551 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.15 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25 
 
 		 636 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  24.54 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.71 
 
 		 586 aa  160  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.05 
 
 		 541 aa  159  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>