173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2061 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  96.41 
 
 		 557 aa  1010    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  100 
 
 		 557 aa  1093    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  55.2 
 
 		 561 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  50.45 
 
 		 543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  48.29 
 
 		 543 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  35.85 
 
 		 562 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  32.36 
 
 		 557 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.64 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.23 
 
 		 541 aa  293  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.54 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.72 
 
 		 556 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.53 
 
 		 548 aa  289  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.39 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.05 
 
 		 541 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  29.8 
 
 		 537 aa  280  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.75 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  29.98 
 
 		 537 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.76 
 
 		 554 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.42 
 
 		 574 aa  246  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.42 
 
 		 643 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.55 
 
 		 566 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.03 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.88 
 
 		 567 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.45 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1780  Na+/Pi-cotransporter  33.4 
 
 		 544 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.41 
 
 		 538 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.13 
 
 		 559 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.91 
 
 		 584 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.85 
 
 		 563 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.81 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.81 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  31.41 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.17 
 
 		 556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.64 
 
 		 549 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.13 
 
 		 590 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  29.93 
 
 		 549 aa  216  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.97 
 
 		 636 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.81 
 
 		 535 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  27.16 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  27.16 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  26.79 
 
 		 551 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.62 
 
 		 551 aa  207  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  27.52 
 
 		 551 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  26.97 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  27.16 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  27.02 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  26.61 
 
 		 551 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  34.71 
 
 		 586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.37 
 
 		 565 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  25.89 
 
 		 551 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.65 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.94 
 
 		 551 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.22 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  33.14 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.57 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.08 
 
 		 564 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  28.62 
 
 		 563 aa  173  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.14 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  27.88 
 
 		 563 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  35.25 
 
 		 600 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  28.84 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  28.28 
 
 		 565 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.68 
 
 		 318 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  28.44 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  28.46 
 
 		 548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.42 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.25 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  29.17 
 
 		 566 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.12 
 
 		 601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  29.18 
 
 		 549 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  25.87 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  28.03 
 
 		 559 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.1 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  25.83 
 
 		 561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  25.87 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.97 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  26.65 
 
 		 548 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.98 
 
 		 576 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.17 
 
 		 556 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.17 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  25.24 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  25.13 
 
 		 560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  25.41 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.02 
 
 		 552 aa  134  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.55 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.05 
 
 		 559 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.83 
 
 		 546 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  25.23 
 
 		 558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.37 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.15 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  32.58 
 
 		 289 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.21 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  25.58 
 
 		 550 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  24.5 
 
 		 558 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.3 
 
 		 552 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.37 
 
 		 548 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.3 
 
 		 552 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.42 
 
 		 548 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>