171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0069 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  81.85 
 
 
552 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.99 
 
 
543 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  95.64 
 
 
550 aa  998    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.94 
 
 
548 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  100 
 
 
550 aa  1087    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  83.91 
 
 
552 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  63.99 
 
 
543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  67.77 
 
 
582 aa  722    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.75 
 
 
548 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  63.99 
 
 
543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  81.11 
 
 
552 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.62 
 
 
543 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  74.44 
 
 
546 aa  762    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  81.67 
 
 
552 aa  885    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  68.1 
 
 
582 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  63.99 
 
 
543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  65.85 
 
 
549 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  63.99 
 
 
543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  63.99 
 
 
543 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  81.11 
 
 
552 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  60.26 
 
 
548 aa  621  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  61.75 
 
 
548 aa  621  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  64.23 
 
 
568 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  61.8 
 
 
570 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  57.04 
 
 
562 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  58.86 
 
 
561 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  58.89 
 
 
565 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  52.9 
 
 
563 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  55.51 
 
 
558 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.91 
 
 
576 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  48.01 
 
 
552 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.87 
 
 
556 aa  472  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.87 
 
 
556 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.97 
 
 
577 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.54 
 
 
559 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  48.67 
 
 
553 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  48.67 
 
 
553 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  46.77 
 
 
548 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  39.71 
 
 
563 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  39.05 
 
 
565 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.56 
 
 
565 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.27 
 
 
601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  34.64 
 
 
557 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  33.71 
 
 
556 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  36.07 
 
 
561 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  33.89 
 
 
560 aa  294  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  33.09 
 
 
548 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  33.83 
 
 
558 aa  289  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.61 
 
 
562 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.01 
 
 
548 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  33.64 
 
 
558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.48 
 
 
547 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.51 
 
 
553 aa  276  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  33.59 
 
 
548 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  33.52 
 
 
548 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  33.57 
 
 
578 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.02 
 
 
548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  38.37 
 
 
561 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  38.94 
 
 
561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  39.13 
 
 
564 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  30.57 
 
 
562 aa  226  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  33.27 
 
 
542 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  35.09 
 
 
555 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  35.28 
 
 
555 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.98 
 
 
535 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25 
 
 
567 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.32 
 
 
563 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.55 
 
 
566 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.83 
 
 
556 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  23.65 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  23.09 
 
 
537 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.11 
 
 
558 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.27 
 
 
565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.9 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.96 
 
 
643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.95 
 
 
541 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.61 
 
 
536 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.09 
 
 
556 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.14 
 
 
541 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.33 
 
 
541 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.63 
 
 
539 aa  159  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.3 
 
 
549 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.76 
 
 
541 aa  158  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.49 
 
 
554 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  23.82 
 
 
544 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  23.63 
 
 
551 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  23.82 
 
 
551 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  23.63 
 
 
551 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  23.63 
 
 
551 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.05 
 
 
555 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.05 
 
 
555 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  23.44 
 
 
551 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>