25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2799 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
1021 aa  2024    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  36.77 
 
 
1029 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  33.43 
 
 
1027 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.73 
 
 
1066 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.42 
 
 
1009 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  35.24 
 
 
1031 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  34.67 
 
 
1074 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.81 
 
 
1035 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.43 
 
 
1042 aa  356  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.57 
 
 
915 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.51 
 
 
729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  47.49 
 
 
373 aa  263  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.99 
 
 
964 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.03 
 
 
968 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.3 
 
 
1038 aa  135  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.72 
 
 
1013 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.7 
 
 
1036 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.17 
 
 
1148 aa  97.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.4 
 
 
1042 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.67 
 
 
1060 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.43 
 
 
1055 aa  82  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.8 
 
 
987 aa  75.5  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  73.33 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.38 
 
 
757 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  26.45 
 
 
317 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>