23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3315 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  100 
 
 
1027 aa  2041    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  42.36 
 
 
1042 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  44.91 
 
 
1035 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  38.42 
 
 
1029 aa  519  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  37.74 
 
 
1066 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  36.89 
 
 
1074 aa  479  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.43 
 
 
1021 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.75 
 
 
1009 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  36.71 
 
 
1031 aa  429  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.3 
 
 
915 aa  326  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.77 
 
 
729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.28 
 
 
964 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.88 
 
 
968 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  34.78 
 
 
373 aa  155  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.29 
 
 
1036 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.05 
 
 
1038 aa  117  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.56 
 
 
1148 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.03 
 
 
1042 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.05 
 
 
1060 aa  88.6  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.72 
 
 
757 aa  87  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.78 
 
 
1013 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.4 
 
 
1055 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.4 
 
 
987 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>