21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4694 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
987 aa  1888    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.46 
 
 
1038 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.85 
 
 
1013 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.55 
 
 
1036 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.39 
 
 
1042 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.42 
 
 
1060 aa  121  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.23 
 
 
968 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  23 
 
 
757 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.05 
 
 
1148 aa  111  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  32.4 
 
 
1074 aa  107  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.46 
 
 
1055 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.31 
 
 
1066 aa  104  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  29.35 
 
 
1029 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.29 
 
 
1021 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  33.7 
 
 
1031 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.88 
 
 
964 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  25.41 
 
 
1027 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  29.65 
 
 
373 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  30.51 
 
 
317 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.71 
 
 
1009 aa  58.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  30.21 
 
 
518 aa  44.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>