26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0903 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
1036 aa  2130    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.79 
 
 
1038 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.98 
 
 
1055 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.78 
 
 
1042 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.12 
 
 
1013 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.97 
 
 
1148 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.07 
 
 
1060 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.47 
 
 
757 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  36.61 
 
 
317 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  25.9 
 
 
1029 aa  152  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.05 
 
 
987 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  23.75 
 
 
1031 aa  131  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.29 
 
 
968 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.61 
 
 
1042 aa  125  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  25.56 
 
 
1074 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  24.29 
 
 
1027 aa  121  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.38 
 
 
964 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.12 
 
 
1066 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.7 
 
 
1021 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.66 
 
 
1035 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.17 
 
 
1009 aa  91.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.38 
 
 
729 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  26.51 
 
 
373 aa  65.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.66 
 
 
915 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  26.71 
 
 
322 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  27.05 
 
 
904 aa  45.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>