25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4647 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  42.59 
 
 
1027 aa  695    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
1042 aa  2026    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  56.83 
 
 
1035 aa  1013    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  36.52 
 
 
1029 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.59 
 
 
1021 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.47 
 
 
1066 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  35.11 
 
 
1074 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.35 
 
 
1009 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  35.5 
 
 
1031 aa  354  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.12 
 
 
729 aa  286  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.43 
 
 
915 aa  277  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.97 
 
 
968 aa  201  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.84 
 
 
964 aa  154  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.61 
 
 
1036 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.76 
 
 
1042 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.26 
 
 
1038 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  32.41 
 
 
373 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.86 
 
 
1148 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.44 
 
 
1013 aa  96.3  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.98 
 
 
757 aa  91.3  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.79 
 
 
1060 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.48 
 
 
1055 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.84 
 
 
904 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.28 
 
 
987 aa  48.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  21.96 
 
 
895 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>