22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3936 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
729 aa  1429    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  38.05 
 
 
1066 aa  351  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  37.11 
 
 
1029 aa  345  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  38.74 
 
 
1074 aa  331  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.33 
 
 
1009 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.43 
 
 
1035 aa  311  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  35.89 
 
 
1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  34.77 
 
 
1027 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.51 
 
 
1021 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.12 
 
 
1042 aa  294  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.78 
 
 
915 aa  278  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.5 
 
 
968 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.81 
 
 
964 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.82 
 
 
1038 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.38 
 
 
1036 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.1 
 
 
1148 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.02 
 
 
1013 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.5 
 
 
757 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.9 
 
 
1055 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.26 
 
 
1060 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.46 
 
 
1042 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.73 
 
 
987 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>