28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2033 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  100 
 
 
1031 aa  2022    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  43.97 
 
 
1074 aa  601  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  40.56 
 
 
1029 aa  522  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  39.67 
 
 
1066 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  37.19 
 
 
1027 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.22 
 
 
1021 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.69 
 
 
1009 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.89 
 
 
1035 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.42 
 
 
915 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.24 
 
 
1042 aa  389  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.95 
 
 
729 aa  323  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.28 
 
 
964 aa  204  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.85 
 
 
968 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  38.9 
 
 
373 aa  185  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.61 
 
 
1038 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.88 
 
 
1036 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.31 
 
 
1042 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.15 
 
 
1013 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.33 
 
 
1060 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.05 
 
 
987 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.32 
 
 
1148 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.04 
 
 
1055 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.41 
 
 
757 aa  51.6  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  41.94 
 
 
693 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4649  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  45.8  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1334  hypothetical protein  36.54 
 
 
276 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.368124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  35.45 
 
 
322 aa  44.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>