14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1334 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1334  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  554  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.368124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4466  putative O-methyltransferase  74.05 
 
 
260 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0604  putative O-methyltransferase  43.7 
 
 
289 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2031  putative O-methyltransferase  42.36 
 
 
281 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1125  hypothetical protein  36.92 
 
 
346 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3996  hypothetical protein  39.18 
 
 
265 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1823  putative O-methyltransferase  37.92 
 
 
283 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.509784  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3312  hypothetical protein  39.85 
 
 
750 aa  148  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224991  normal  0.22315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  37.94 
 
 
322 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6753  hypothetical protein  42.62 
 
 
255 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4649  hypothetical protein  36.06 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  39.61 
 
 
693 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0204  putative O-methyltransferase  43.75 
 
 
145 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650886  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1841  hypothetical protein  31.66 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.447745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>