14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1841 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1841  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.447745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  38.38 
 
 
322 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4649  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1125  hypothetical protein  37.92 
 
 
346 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3312  hypothetical protein  32.46 
 
 
750 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224991  normal  0.22315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2031  putative O-methyltransferase  35.18 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1334  hypothetical protein  30.98 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.368124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4466  putative O-methyltransferase  33.2 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0604  putative O-methyltransferase  32.07 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  35.24 
 
 
693 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3996  hypothetical protein  29.18 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6753  hypothetical protein  29.91 
 
 
255 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1823  putative O-methyltransferase  29.07 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.509784  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0204  putative O-methyltransferase  34.45 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650886  normal  0.0750661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>