14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0204 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0204  putative O-methyltransferase  100 
 
 
145 aa  289  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650886  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3996  hypothetical protein  67.46 
 
 
265 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6753  hypothetical protein  72.9 
 
 
255 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1823  putative O-methyltransferase  42.31 
 
 
283 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.509784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1334  hypothetical protein  43.75 
 
 
276 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.368124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4466  putative O-methyltransferase  43.97 
 
 
260 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2031  putative O-methyltransferase  40 
 
 
281 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3312  hypothetical protein  39.06 
 
 
750 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224991  normal  0.22315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1125  hypothetical protein  38.35 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0604  putative O-methyltransferase  40.98 
 
 
289 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4649  hypothetical protein  38.06 
 
 
330 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  36.09 
 
 
693 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  39.52 
 
 
322 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1841  hypothetical protein  33.94 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.447745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>