22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2737 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2737  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1118    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2542  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1118    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3447  hypothetical protein  43.84 
 
 		 544 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5548  phage integrase family protein  48.46 
 
 		 276 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0907642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6373  hypothetical protein  39.52 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4727  hypothetical protein  31.3 
 
 		 590 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4216  hypothetical protein  29.79 
 
 		 573 aa  143  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4276  hypothetical protein  28.98 
 
 		 560 aa  137  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4722  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5550  hypothetical protein  30.85 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0804731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0046  hypothetical protein  50.75 
 
 		 114 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0580  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5941  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0476  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  31.37 
 
 		 385 aa  51.2  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1084  integrase/recombinase XerD, putative  29.33 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.636718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 319 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  22.6 
 
 		 291 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 298 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  29.05 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>