20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4276 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4276  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1147    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4216  hypothetical protein  85.71 
 
 
573 aa  965    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4727  hypothetical protein  37.04 
 
 
590 aa  339  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3447  hypothetical protein  28.65 
 
 
544 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2542  integrase domain-containing protein  28.65 
 
 
554 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2737  integrase domain-containing protein  28.65 
 
 
554 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4722  hypothetical protein  38.53 
 
 
230 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6373  hypothetical protein  32.88 
 
 
422 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5548  phage integrase family protein  33.46 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0907642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5941  phage integrase family protein  27.82 
 
 
544 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345865  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0580  phage integrase family protein  27.82 
 
 
547 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0476  phage integrase family protein  27.82 
 
 
544 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2589  hypothetical protein  73.17 
 
 
62 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100528  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  25.13 
 
 
306 aa  47.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.2 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  25 
 
 
304 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  25.09 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0046  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.64 
 
 
314 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  24.37 
 
 
312 aa  43.9  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>