14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6373 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6373  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3447  hypothetical protein  39.62 
 
 		 544 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2542  integrase domain-containing protein  39.52 
 
 		 554 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2737  integrase domain-containing protein  39.52 
 
 		 554 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5548  phage integrase family protein  41.91 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0907642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0046  hypothetical protein  82.09 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4727  hypothetical protein  32.57 
 
 		 590 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4276  hypothetical protein  32.88 
 
 		 560 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4722  hypothetical protein  34.35 
 
 		 230 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4216  hypothetical protein  30.43 
 
 		 573 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0476  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5941  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0580  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  33.88 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>