21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0799 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  80.05 
 
 
482 aa  671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  56.98 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  51.18 
 
 
439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  52.25 
 
 
440 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  50.59 
 
 
450 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  50.59 
 
 
450 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  49.29 
 
 
450 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  45.62 
 
 
447 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  44.47 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  42.45 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  39.39 
 
 
429 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  39.86 
 
 
430 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  34.11 
 
 
422 aa  281  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  35.71 
 
 
438 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  35.89 
 
 
435 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  28.87 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  39.75 
 
 
252 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  26.89 
 
 
434 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3119  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000244362  unclonable  0.0000043186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>