20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1300 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  71.39 
 
 		 438 aa  635    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  874    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  71.67 
 
 		 435 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  47.04 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  46.92 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  44.37 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  41.51 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  74.89 
 
 		 252 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  37.62 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  37.67 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  38.59 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  32.15 
 
 		 439 aa  272  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  34.15 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  36.21 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  34.98 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  65.54 
 
 		 179 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  33.1 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  29.71 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>