21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0436 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  81.9 
 
 
439 aa  760    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  929    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  99.78 
 
 
450 aa  927    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  55.58 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  50.57 
 
 
440 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  48.88 
 
 
482 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  50.59 
 
 
479 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  47.62 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  43.76 
 
 
447 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  41.49 
 
 
430 aa  323  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  40.43 
 
 
425 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  39.54 
 
 
429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  40 
 
 
443 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  32.94 
 
 
422 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  34.29 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  32.94 
 
 
435 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  32.56 
 
 
438 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  26.6 
 
 
434 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  28.88 
 
 
179 aa  67  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1107  peptidase M28  25.98 
 
 
576 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>