19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1312 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  96.8 
 
 
435 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  96.05 
 
 
438 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  74.89 
 
 
422 aa  384  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  51.21 
 
 
447 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  56.64 
 
 
425 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  51.27 
 
 
430 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  46.47 
 
 
429 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  51.6 
 
 
443 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  40.93 
 
 
482 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  39.41 
 
 
429 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  38.11 
 
 
479 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  41.84 
 
 
450 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  36.32 
 
 
439 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  37.77 
 
 
440 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  35.29 
 
 
450 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  35.29 
 
 
450 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  42.36 
 
 
412 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  27.75 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>