20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13451 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  877    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  27.97 
 
 
443 aa  163  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  28.46 
 
 
450 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  26.47 
 
 
440 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  28.92 
 
 
447 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  27.08 
 
 
482 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  26.4 
 
 
429 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  26.63 
 
 
479 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  26.86 
 
 
425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  26.3 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  29.61 
 
 
438 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  25.66 
 
 
429 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  29.71 
 
 
422 aa  123  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  28.46 
 
 
412 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  29.31 
 
 
435 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  26.87 
 
 
450 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  26.87 
 
 
450 aa  117  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  27.71 
 
 
430 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  39.53 
 
 
179 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>