21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1684 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  885    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  69.16 
 
 
429 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  54.18 
 
 
447 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  55.16 
 
 
425 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  47.09 
 
 
435 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  44.71 
 
 
422 aa  398  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  46.3 
 
 
438 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  45.23 
 
 
429 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  42.62 
 
 
439 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  41.76 
 
 
450 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  41.98 
 
 
450 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  41.22 
 
 
450 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  40.81 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  41.59 
 
 
443 aa  312  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  42.23 
 
 
482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  40.2 
 
 
479 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  51.27 
 
 
252 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  35.91 
 
 
412 aa  249  9e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  40.78 
 
 
179 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  27.71 
 
 
434 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1107  peptidase M28  25 
 
 
576 aa  47  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>