19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1440 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386026  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  38.81 
 
 		 5128 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 1509 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1465 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  36.45 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1291 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  29.37 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  28.68 
 
 		 5185 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  29.37 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  29.37 
 
 		 1409 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  29.37 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  29.37 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  34.17 
 
 		 3036 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  31.11 
 
 		 1388 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0313  hypothetical protein  32.59 
 
 		 145 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0540647  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  30.08 
 
 		 1362 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0243  hypothetical protein  34.78 
 
 		 146 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  31.51 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1301 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>