20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1102 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1102  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  626  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
392 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.03 
 
 
746 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07687  mitochondrial outer membrane translocase receptor (TOM70), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01660)  29.8 
 
 
636 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.146912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
425 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28.32 
 
 
398 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
1421 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.35 
 
 
745 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3035 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
166 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
166 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1126  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
134 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000467816  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
543 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  28.1 
 
 
559 aa  42.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>