30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0022 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0022  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  100 
 
 		 602 aa  1255    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4298  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.98 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.524718 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_13  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  41.83 
 
 		 572 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4383  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.72 
 
 		 600 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4507  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.72 
 
 		 604 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4622  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.2 
 
 		 604 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4530  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  32.26 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4437  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.25 
 
 		 604 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4433  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  32.49 
 
 		 605 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.345027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0033  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  27.52 
 
 		 599 aa  190  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  unclonable  0.00256086  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0025  hypothetical protein  24.67 
 
 		 563 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4233  hypothetical protein  33.55 
 
 		 702 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3998  mating pair stabilisation TraN  29.55 
 
 		 704 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5379  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  26.3 
 
 		 620 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.829255 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0381  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  45.24 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6809  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  41.38 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  37.88 
 
 		 730 aa  90.9  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0953  hypothetical protein  37.88 
 
 		 150 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00613507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1528  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 805 aa  84  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0144245  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0101  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.45 
 
 		 931 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0283794 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6214  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  39.22 
 
 		 485 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0251  hypothetical protein  43.9 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2327  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.59 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00873453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4171  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.71 
 
 		 414 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.366159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2660  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.75 
 
 		 706 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1598  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.11 
 
 		 911 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0314  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1124 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3775  hypothetical protein  30.56 
 
 		 681 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1097  conjugal transfer protein TraN, putative  29.13 
 
 		 1019 aa  60.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4206  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1424 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>