30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3775 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3775  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1403    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0314  hypothetical protein  55.88 
 
 		 1124 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0251  hypothetical protein  54.64 
 
 		 613 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0381  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.68 
 
 		 564 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1528  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  27.16 
 
 		 805 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0144245  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2660  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  28.07 
 
 		 706 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2327  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  27.11 
 
 		 704 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00873453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  43.61 
 
 		 730 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0953  hypothetical protein  43.31 
 
 		 150 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00613507  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0101  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  33.85 
 
 		 931 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0283794 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3998  mating pair stabilisation TraN  37.5 
 
 		 704 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4171  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  26.28 
 
 		 414 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.366159 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5379  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  43.81 
 
 		 620 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.829255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1598  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.77 
 
 		 911 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6214  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.04 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4298  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  38.32 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.524718 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_13  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  40.38 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6809  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  26.97 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4383  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  37.37 
 
 		 600 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4530  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  37.37 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4622  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  37.37 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4507  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.27 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4433  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  37.37 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.345027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1097  conjugal transfer protein TraN, putative  26.32 
 
 		 1019 aa  71.6  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4437  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.36 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4206  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1424 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4233  hypothetical protein  34 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0022  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.8 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0033  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.21 
 
 		 599 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  unclonable  0.00256086  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0025  hypothetical protein  34.83 
 
 		 563 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>