31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2327 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2327  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  100 
 
 		 704 aa  1451    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00873453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2660  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  92.49 
 
 		 706 aa  1362    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1528  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  68.48 
 
 		 805 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0144245  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4171  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.11 
 
 		 414 aa  211  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.366159 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0381  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  32.49 
 
 		 564 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6809  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  28.57 
 
 		 426 aa  147  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  50 
 
 		 730 aa  120  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0953  hypothetical protein  48.76 
 
 		 150 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00613507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0251  hypothetical protein  28.06 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5379  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  38.52 
 
 		 620 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.829255 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3998  mating pair stabilisation TraN  42.64 
 
 		 704 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6214  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  27.2 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0314  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1124 aa  94  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4383  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 600 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4433  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 605 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.345027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4530  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 605 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4507  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 604 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4622  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 604 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4437  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.44 
 
 		 604 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3775  hypothetical protein  35.51 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0022  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.59 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1097  conjugal transfer protein TraN, putative  33.82 
 
 		 1019 aa  78.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4298  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.78 
 
 		 618 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.524718 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0101  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  31.82 
 
 		 931 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0283794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1598  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  31.82 
 
 		 911 aa  75.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0033  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  28.49 
 
 		 599 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  unclonable  0.00256086  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_13  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  33.91 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4233  hypothetical protein  28.85 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0025  hypothetical protein  25 
 
 		 563 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4206  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1424 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4172  hypothetical protein  24.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>