29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1598 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1598  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  100 
 
 		 911 aa  1883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0101  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  58.4 
 
 		 931 aa  1038    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0283794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1097  conjugal transfer protein TraN, putative  28.71 
 
 		 1019 aa  158  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4206  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1424 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0381  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.36 
 
 		 564 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5379  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  38.32 
 
 		 620 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.829255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2327  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  24.82 
 
 		 704 aa  92  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00873453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4233  hypothetical protein  35.85 
 
 		 702 aa  87.8  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2660  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  24.63 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4298  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  39.09 
 
 		 618 aa  86.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.524718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0251  hypothetical protein  32.45 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  40 
 
 		 730 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3998  mating pair stabilisation TraN  34.95 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6809  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.51 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4171  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.95 
 
 		 414 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.366159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1528  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.55 
 
 		 805 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0144245  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3775  hypothetical protein  33.01 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0953  hypothetical protein  39.39 
 
 		 150 aa  77.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00613507  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4383  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.17 
 
 		 600 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0022  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.11 
 
 		 602 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4530  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.17 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4433  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.17 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.345027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4507  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.17 
 
 		 604 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0314  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1124 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4622  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.17 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_13  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.58 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4437  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.11 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0033  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.35 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  unclonable  0.00256086  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6214  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  27.18 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>