30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0953 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0953  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00613507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  90.21 
 
 
730 aa  264  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0251  hypothetical protein  49.25 
 
 
613 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2327  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  48.76 
 
 
704 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00873453  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0314  hypothetical protein  45.52 
 
 
1124 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2660  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  50 
 
 
706 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1528  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  47.9 
 
 
805 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0144245  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0381  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  42.22 
 
 
564 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3998  mating pair stabilisation TraN  42.86 
 
 
704 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5379  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  44.27 
 
 
620 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.829255 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3775  hypothetical protein  43.65 
 
 
681 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4383  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.72 
 
 
600 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4530  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.72 
 
 
605 aa  93.6  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4433  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.72 
 
 
605 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.345027  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4622  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.72 
 
 
604 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4507  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.72 
 
 
604 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4437  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  35.94 
 
 
604 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4171  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  50 
 
 
414 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.366159 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0022  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  37.88 
 
 
602 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1097  conjugal transfer protein TraN, putative  35.97 
 
 
1019 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_13  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.51 
 
 
572 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0101  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  37.82 
 
 
931 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0283794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1598  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  39.39 
 
 
911 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6809  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  41.58 
 
 
426 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4233  hypothetical protein  35.96 
 
 
702 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4298  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.38 
 
 
618 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.524718 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0033  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  38 
 
 
599 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  unclonable  0.00256086  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6214  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  38.32 
 
 
485 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647051  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4206  hypothetical protein  34.58 
 
 
1424 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0025  hypothetical protein  29.41 
 
 
563 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>