27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0025 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006366  plpl0025  hypothetical protein  100 
 
 
563 aa  1176    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0022  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  24.67 
 
 
602 aa  170  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0033  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  26.55 
 
 
599 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  unclonable  0.00256086  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4383  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.24 
 
 
600 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4507  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.99 
 
 
604 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4530  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.71 
 
 
605 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4433  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.17 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.345027  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4622  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.17 
 
 
604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_13  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  30.94 
 
 
572 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4437  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.83 
 
 
604 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4298  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  29.68 
 
 
618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.524718 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3998  mating pair stabilisation TraN  26.84 
 
 
704 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4233  hypothetical protein  24.1 
 
 
702 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5379  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  23.99 
 
 
620 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.829255 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0381  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  34.91 
 
 
564 aa  63.9  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0940  lectin C-type domain-containing protein  28.24 
 
 
730 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00780626  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4171  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  31.33 
 
 
414 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.366159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2660  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  36.36 
 
 
706 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2327  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  25 
 
 
704 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00873453  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0314  hypothetical protein  31.09 
 
 
1124 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0251  hypothetical protein  32.97 
 
 
613 aa  54.3  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6214  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  38.57 
 
 
485 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647051  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1528  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  25.91 
 
 
805 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0144245  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0953  hypothetical protein  29.41 
 
 
150 aa  50.4  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00613507  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3775  hypothetical protein  34.83 
 
 
681 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6809  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  27.88 
 
 
426 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4206  hypothetical protein  22.68 
 
 
1424 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>