199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2593 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2593  putative ethanolamine utilization protein EutK  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02338  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1223  microcompartments protein  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2575  putative ethanolamine utilization protein EutK  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2724  putative ethanolamine utilization protein EutK  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02300  hypothetical protein  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2810  putative ethanolamine utilization protein EutK  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1241  microcompartments protein  98.8 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3668  putative ethanolamine utilization protein EutK  98.8 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2648  putative ethanolamine utilization protein EutK  81.71 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2689  ethanolamine utilization protein EutK  80.49 
 
 		 164 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2822  putative ethanolamine utilization protein EutK  80.49 
 
 		 164 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2715  ethanolamine utilization protein EutK  80.49 
 
 		 164 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2600  putative ethanolamine utilization protein EutK  80.49 
 
 		 164 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  43.88 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  46.43 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  43.82 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  43.82 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  42.35 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  37.08 
 
 		 96 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  47.37 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  48.1 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  38.82 
 
 		 103 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  38.82 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  38.82 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  38.82 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  46.51 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  48.24 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  49.41 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  37.65 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  37.65 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  37.65 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  37.65 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  43.43 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  37.65 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  46.15 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  46.51 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  36.47 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  36.47 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  36.47 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  45.45 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  36.47 
 
 		 102 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  47.06 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  36.36 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  48.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  46.51 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  48.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  48.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  48.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  48.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  45.16 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  40.74 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  45.05 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  48.24 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  39.36 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  48.15 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  36.47 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  43.68 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  45.35 
 
 		 96 aa  62  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  46.43 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  44.05 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  45.35 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  44.19 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  41.86 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  45 
 
 		 256 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  45.92 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  35.29 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  48.28 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  41.86 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  41.38 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  39.22 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  47.62 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  45.45 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  40.23 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  43.02 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  45.78 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  45.78 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  40.2 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0358  microcompartments protein  44.58 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  45.78 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  45.78 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1414  microcompartments protein  40.91 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  45.78 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  44.05 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  43.82 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  42.86 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  45.24 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0507  propanediol utilization  49.41 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.543928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  46.99 
 
 		 97 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  37.89 
 
 		 98 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  41.46 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  46.99 
 
 		 97 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  46.99 
 
 		 97 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  44.71 
 
 		 96 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>