More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0566 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0566  TerC family membrane protein  100 
 
 
228 aa  435  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0659342  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0465  TerC family integral membrane protein  78.32 
 
 
227 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  38.91 
 
 
252 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  39.27 
 
 
261 aa  148  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  35.48 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  36.12 
 
 
241 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  34.4 
 
 
238 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  35.96 
 
 
238 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  36.28 
 
 
245 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  35.14 
 
 
259 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  38.64 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  34.25 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0194  TerC family membrane protein  44.98 
 
 
235 aa  139  3e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  33.63 
 
 
295 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  32.43 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  35.81 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  32.16 
 
 
522 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  32.16 
 
 
522 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  33.04 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  32.46 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  31.22 
 
 
519 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  34.88 
 
 
510 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  31.22 
 
 
519 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  31.22 
 
 
519 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  31.22 
 
 
519 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  31.22 
 
 
519 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  31.22 
 
 
516 aa  137  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  34.86 
 
 
247 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  34.23 
 
 
243 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  32.74 
 
 
247 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  31.22 
 
 
518 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  34.42 
 
 
250 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  33.63 
 
 
245 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  31.72 
 
 
518 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  35 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  30.36 
 
 
514 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  30.32 
 
 
518 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  32.27 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 
257 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  34.36 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 
518 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1494  hypothetical protein  33.48 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  32.58 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  30.91 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1489  hypothetical protein  33.48 
 
 
243 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  32.75 
 
 
246 aa  132  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  30.09 
 
 
523 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  33.8 
 
 
253 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  31.39 
 
 
249 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0836  integral membrane protein TerC  36.15 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  30.09 
 
 
523 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
523 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 
522 aa  131  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  30.09 
 
 
523 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  33.03 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  30 
 
 
518 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  30.49 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  34.25 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  31.33 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  34.56 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  34.56 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  34.56 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  34.56 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  34.56 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  31.96 
 
 
253 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  30.26 
 
 
251 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  31.25 
 
 
250 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  30.8 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  30.8 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  28.5 
 
 
527 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  31.19 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  31.36 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  34.4 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3686  Integral membrane protein TerC  36.49 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02536  hypothetical protein  34.55 
 
 
255 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  31.25 
 
 
253 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  34.56 
 
 
237 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  30.56 
 
 
577 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  30.8 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  32 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  30.56 
 
 
528 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  32.74 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  36.2 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  38.29 
 
 
249 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>