17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1542 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1542  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase beta subunit-like protein  100 
 
 		 436 aa  898    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  25.39 
 
 		 513 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  24.9 
 
 		 519 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  25.89 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  26.11 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  23.3 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  27.91 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  23.3 
 
 		 516 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  22.47 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  24.71 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  28.24 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  22.27 
 
 		 523 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  28.1 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  26 
 
 		 517 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.83 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  34.41 
 
 		 522 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 		 680 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>