26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1313 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.607522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  28.96 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  22.56 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  23.38 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  23.38 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  22.56 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  24.18 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  28.85 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.17 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.96 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  23.5 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  25.91 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  22.56 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  25.85 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.23 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  25.41 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  27.31 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.74 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  28.33 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  28.33 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>