199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0035 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0017  tRNA-Gln  95.95 
 
 		 75 bp  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0007  tRNA-Gln  96.05 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000424664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0020  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0035  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000188395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  87.88 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0017  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0010  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna3  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0066  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0358271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna0  tRNA-Gln  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0057  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0042  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0020  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000533123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0001  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.587536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0001  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.857987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0045  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0045  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>