23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0007 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0007  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000424664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0017  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0035  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000188395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0020  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0020  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000533123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna3  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0078  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>